作為世界著名植物抗癌天然產(chǎn)物藥物,紫杉醇廣泛應用於乳腺癌、卵巢癌等多種癌癥臨床治療,過去只能依靠珍稀瀕危裸子植物紅豆杉提取。中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學與技術廣東省實驗室深圳分中心)(下稱「基因組所」)與國內(nèi)外多家單位合作,鑑定得到紫杉醇生物合成途徑的關鍵缺失酶,揭示了植物細胞催化氧雜環(huán)丁烷結(jié)構(gòu)形成的全新機制,建立了迄今為止最短的紫杉醇生物合成途徑,為今後不依賴紅豆杉生物合成紫杉醇提供科學指導。
1月26日,相關研究成果發(fā)表在世界頂尖學術期刊《科學(Science)》上。
基因組所閆建斌研究員表示,天然紫杉醇僅能從珍稀瀕危裸子植物紅豆杉中提取,產(chǎn)量稀缺且來源單一。紅豆杉生長速度緩慢,極為稀少,素有「植物大熊貓」之稱。不僅如此,紫杉醇在紅豆杉植物中的含量極低,數(shù)千棵紅豆杉中僅能提取出1公斤左右的紫杉醇。
半個世紀以來,紫杉醇生物合成途徑依然未被完全解析,成為科學界一直關注的難點。
如何不依賴紅豆杉,實現(xiàn)紫杉醇的生物合成?各國科學家一直在尋找一種可以替代天然提取紫杉醇的合成方法。然而,由於紫杉醇生物合成途徑高度複雜,半個世紀以來,該通路依然未被完全解析,成為世界級難題。
據(jù)了解,這次重大突破始於首張南方紅豆杉基因組藍圖。為了解開這一難題,基因組所閆建斌研究員領銜於2021年率先繪製國際首張染色體級別的南方紅豆杉高質(zhì)量參考基因組圖譜,鑑定出紅豆杉獨有的紫杉醇生物合成相關基因家族,並揭示了紫杉醇合成相關基因的全基因組定位與茉莉素介導的協(xié)同表達調(diào)控規(guī)律,鑑定了首個紫杉醇生物合成基因簇,為紫杉醇生物合成途徑的解析提供了基因組學藍圖和關鍵候選基因。
該研究綜合利用基因組學、代謝組學、生物化學、分子生物學、化學生物學、合成生物學等技術手段,對多個紫杉醇生物合成關鍵候選基因進行篩選,成功發(fā)現(xiàn)了紫杉烷氧雜環(huán)丁烷合酶和紫杉烷碳9位氧化酶,並進一步解析了植物中氧雜環(huán)丁烷結(jié)構(gòu)形成的催化機制,改變了環(huán)氧化物是生成氧雜環(huán)丁烷的先決條件的傳統(tǒng)認知。在此基礎上,科研人員通過人工異源合成途徑構(gòu)建策略,利用植物底盤實現(xiàn)了合成路線的人工重構(gòu),成功在植物底盤中以9個關鍵合成酶生成了紫杉醇工業(yè)化生產(chǎn)前體巴卡亭Ⅲ。
該研究不僅發(fā)現(xiàn)最具挑戰(zhàn)的未知酶,鑑定紫杉烷氧雜環(huán)丁烷合成酶;更顛覆傳統(tǒng)認知,闡明植物含氧四元環(huán)結(jié)構(gòu)的生物合成新機制。同時,標誌著我國在紫杉醇合成生物學理論和技術上站在了世界領先地位,相關研究成果已申請或獲得多項專利,為中國紫杉醇綠色製造產(chǎn)業(yè)化鋪平了道路。
據(jù)了解,該研究得到了國家重點研發(fā)計劃、中國農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程、廣東省、北京市、深圳市及大鵬新區(qū)等項目的支持。(深圳商報記者 張宇婷 張妍 通訊員 馬昕怡 文/圖)
頂圖:基因組所閆建斌研究員講述科研成果。